Domperidone hầu như được chuyển hóa hoàn toàn bởi CYP3A4, và vì lý do này, các chất ức chế và cảm ứng của enzyme này có thể làm thay đổi quá trình chuyển hóa và nồng độ của domperidone. Hơn nữa, domperidone đã được xác định là chất ức chế CYP3A4 (Ki = 12 μM) dựa trên cơ chế khiêm tốn và ước tính có thể làm tăng nồng độ trong huyết thanh của chất nền CYP3A4 khoảng 50%.[50]

Itraconazole và ketoconazole, cả hai được sử dụng để điều trị nhiễm nấm, là chất ức chế CYP3A4 mạnh và làm tăng nồng độ trong huyết tương của domperidone.[51][52] Ở những người tình nguyện khỏe mạnh, ketoconazole làm tăng nồng độ C<sub id="mwAXY">max</sub> và AUC của domperidone lên gấp 3 đến 10 lần.[53] Điều này được đi kèm với việc kéo dài khoảng QT khoảng 10 phút20 mili giây khi domperidone 10   mg bốn lần mỗi ngày và ketoconazole 200   mg hai lần mỗi ngày đã được dùng, trong khi domperidone tự dùng với liều lượng được đánh giá không tạo ra hiệu quả như vậy.[53] Như vậy, domperidone với ketoconazole hoặc các chất ức chế CYP3A4 khác là một sự kết hợp nguy hiểm tiềm tàng.[53]

Erythromycin và một số kháng sinh macrolide khác là chất ức chế CYP3A4 và ức chế chuyển hóa domperidone (in vitro), do đó làm tăng nồng độ của domperidone và tác dụng phụ tiềm tàng của thuốc. Điều này rất đáng quan tâm vì cả hai loại thuốc này đều có thể được sử dụng để điều trị bệnh dạ dày.[54]

Có bằng chứng cho thấy không nên dùng domperidone với nước ép bưởi, đây là chất ức chế CYP3A4 được biết đến.[55]